Total Commander

Согласен, с длинными именами все не так просто оказывается.
Вот что наковырял по этому вопросу, зацените:
Для копирования всех файлов в свою папку. Параметры — %P %t.
rem Скрипт создает в целевом (%t) каталоге для каждого файла
rem папку и копирует туда его
for %%i in (%1*.*) do (
md "%2%%~ni ...

Кое-как добрался до Сети... Вот собственно. В параметрах скрипта поставить %p %t.
rem Скрипт создает в целевом (%t) каталоге для каждого файла
rem папку и копирует туда его
@echo off
for %%i in (%1*.*) do (
md %2%%~ni
copy %%i %2%%~ni)
Вариант для выделенных файлов, в параметрах выставить %l %t ...

Скрипт (пакетный файл) реально написать с помощью консольной версии RAR.exe и упомянутого выше ftp.exe.
В справке к архиватору есть детальное описание ключей и примеры написания команд на русском, по ftp.exe детальная справка по /? либо в справочной системе Windows.

Задача решается также и с помощью пакетных файлов.
Причем кода будет куда меньше. Буквально 4-5 строк.
Сейчас сижу на маке, потому только позже могу выложить свой вариант решения сабжа.
Если конечно кому-то еще любопытно.